轻度自闭症的儿童和成人容易出现继发性情绪障碍。许多心理学研究证实，轻度自闭症患者很难确认和定义他人和自己的想法和感受。对于他们来说，无论是人际间的情感交流，还是他们内心的情感世界，都是一个未知的领域，这当然影响了他在与他人交往时对自己内心情绪的检查和管理以及表达和控制的能力。
　　一项关于轻度自闭症与执行功能的研究发现，患者具有无法控制情绪和冲动的特点，缺乏影响一般执行功能的直觉能力。执行功能的缺陷也会影响依靠认知控制情绪的能力。临床经验表明，轻度自闭症患者往往不经思考，直接对情绪线索做出反应。这种快速冲动的反击行为，往往被认为是行为规范障碍，或者是愤怒管理问题。

　　利用神经影像技术检测自闭症和轻度自闭症患者大脑的相关研究发现，他们大脑中控制情绪认知和调节的部分杏仁核出现了结构和功能异常。杏仁核主要调节各种情绪，包括愤怒、焦虑和悲伤。神经解剖学证据也证实，轻度自闭症患者会出现情绪感知和适应问题。
　　另一项研究指出，轻度自闭症患者可能存在面部认知困难，即无法理解面部表情。他们看不懂别人的面部表情。普通人的大脑中有一个特定的区域可以处理面部表情信息，但轻度自闭症患者似乎没有这种能力。他们只是把别人的脸当成一个对象，通常只关注脸的单个部分。这种倾向很容易导致对他人情绪表达的曲解。比如，他们往往认为皱眉只代表愤怒，但实际上，皱眉也可能表达困惑的感情。普通孩子会综合考虑脸上所有的表情信号和环境氛围来判断对方在传递什么情绪。
　　“情绪表达障碍”可以描述轻度自闭症的另一个特征，即他们在确认和描述情绪感受方面存在缺陷。临床研究结果证实，通过轻度自闭症患者在测试中的表现，可以清楚地看到这一特征。轻度自闭症的儿童和成人通常无法用更多的词语来描述情绪感受，尤其是那些微妙复杂的情绪。